與二級市場定增逐步趨冷相反，新三板定向增發近來呈現不斷活躍趨勢。清科數據顯示，截至目前，除去6家已轉板企業，新三板掛牌的116家企業中，有26家已實施定向增發（不含已轉板企業）。新三板成立以來，定增企業數量連年遞增，特別是2009年以來，新三板企業定增規模迅速擴大，且大部分企業定增時都有VC/PE（風險投資/私募股權投資）機構躋身其中，僅2012年就已有8家新三板企業發布定增公告，其中背后顯現出7家VC/PE機構。
在已實施定增的26家掛牌企業中，20家引入了VC/PE投資，涉及VC/PE機構27家，投資總額達3.57億元人民幣。其中表現最為活躍的當數東方匯富旗下子公司天一投資，參與了4家企業的定向增發。投資新三板的VC/PE機構不乏復星創富、中科招商、天堂硅谷、東方匯富、啟迪創投等知名VC/PE機構。此外，德同資本、卡貝基金資本兩家外資PE機構也涉足新三板。
清科研究中心分析師張琦認為，新三板企業目前的價值尚未得到完全開發，大部分企業市盈率分布在10~30倍之間，平均市盈率在20倍左右。目前中小板、創業板的市盈率仍在30倍上下，相比之下，VC/PE機構注資新三板企業的成本較低，日后退出可帶來豐厚回報。
行業方面，VC/PE機構參與定增的新三板企業主要分布在IT、機械制造、電子及光電設備、清潔技術、生物技術/醫療健康、互聯網六大行業。其中，IT行業最受青睞，9家企業獲得投資，機械制造業有5家企業獲得投資位居第二。
2009年和2010年，北陸藥業、世紀瑞爾等三板企業先后通過IPO轉板深圳中小板和創業板，北京科技風投、盈富泰克、國投高科、啟迪創投幾家機構為此收獲頗豐，其中，投資于北陸藥業的北京科技風投賬面回報水平高達19.49倍。
對于新三板未來的擴容改革，張琦認為，VC/PE機構屆時將獲得更多投資標的及資本退出渠道。另外，目前已有多家新三板企業排隊等候上市，一旦轉板成功，企業價值將被重估，VC/PE機構還將獲得被投企業轉板上市的價差收益。
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